土壤是一个充满活力的生态系统，其中微生物是这一系统中最为关键且活跃的组成部分。它们在土壤养分循环与转化、系统稳定性维持、抗干扰能力提升以及可持续生产力形成等方面发挥着主导作用，并通过调控土壤生态系统功能的关键过程，深刻影响着整个土壤生态系统的运行机制。
设施农业种植方式显著改变土壤理化性质，进而影响微生物群落，通常表现为随种植年限延长、群落多样性显著降低或者群落组成改变，例如土壤细菌与真菌比值降低、有益菌群减少、病原微生物数量增加等。通过一些科学实用的方法，可以有效地恢复设施土壤中的微生物群落。以下是一些实用的妙招：
增施微生物肥料
增施微生物肥料是改善设施土壤微生物平衡、提高土壤健康和生产力的重要措施。微生物肥料含多种类型的微生物菌群和活性酶，同时富含有机质，可以有效地改变土壤根际微生态环境，促进养分循环，增强作物抗逆性。
有机、无机肥料配合施用
有机肥既补充输入了有机碳源又改善了土壤性状，为微生物的生长繁殖及活性的提高，创造了有益环境。有机肥与无机肥配合施用可使土壤中有益菌数量增加，从而使土壤微生物区系更合理。
合理耕作
通过合理开展轮作种植，可以为蔬菜生长提供良好的土壤环境，也能使病原菌失去原来的寄主，减少特定病原菌的积累，增加土壤微生物的多样性。间作和套种可以显著改善土壤中微生物总量和细菌数量，使土壤微生态环境得到极大改善。可利用蔬菜的根系分泌物具备抑制某些有害病原菌的特性，进行间作套种，如采用大蒜、香葱、芹菜、茼蒿与主栽蔬菜进行间作或套种，可以明显降低病虫害的发病率和病情指数，显著提高蔬菜产量和品质。
通过上述方法，可以有效恢复土壤微生物区系平衡，提高土壤质量和作物产量，重振土壤生命力，实现农业的可持续发展。
