防治土壤盐碱化的途径和措施很多，但综合防治最为有效，实践证明，实行综合防治必须遵循以下原则。
一、以防为主、防治并重
土壤没有次生盐渍化的地区，要全力预防。已经次生盐渍化的灌区，在当前着重治理的过程中，同时采用防治措施，才能收到事半功倍的效果;得到治理以后，还要坚持以防为主，已经取得改良效果才能得到巩固、提高。
二、水利先行、综合治理
“盐随水来，盐随水去”。水既是土壤积盐或碱化的媒介，也是土壤脱盐或脱碱的动力。控制和调节土壤中水的运动是改良盐碱土的关键，土壤水的运动和平衡是受地表水、地下水和土壤水分蒸发所支配的，因而防治土壤盐碱化必须水利先行，通过水利改良措施达到控制地表水和地下水，使土壤中的下行水流大于上行水流，导致土壤脱盐，并为采用其他改良措施开辟道路。
三、统一规划、因地制宜
土壤水的运动是受地表水和地下水所支配的。要解决好垦区水的问题，必须从流域着手，从建立有利的区域水盐平衡着手，对水土资源进行统一规划、综合平衡，合理安排地表水和地下水的开发利用，建立流域完整的排水、排盐系统。
四、用改结合、脱盐培肥
盐碱地治理包括利用和改良两个方面，两者必须紧密结合，是建设高产稳产田的必由途径。治理盐碱地的最终目的是获得高产稳产，把盐碱地变成良田，为此，必须从两个方面入手，一是脱盐去碱，二是培肥土壤。不脱盐去碱，就不能有效地培肥土壤和发挥土壤的潜在肥力，亦不能保证产量;不培肥土壤，土壤的理化性质不能进一步改善，脱盐效果不能巩固，也不能高产。
五、灌溉与排水相结合
充分考虑水资源承载力，实行总量控制，协同区域灌溉和排水需求，促进农业结构调整，实行灌溉与排水相结合。实行灌溉洗盐和地下水位控制相结合，即实行灌溉洗盐，同时控制地下水位过高而引发新的次生盐碱化。
六、近期和长期相结合
防治土壤次生盐碱化，必须制订统一的规划;所采取的防治措施，一方面要有近期切实可行的内容，另一方面要有长期可预见的方向和目标。只有近期和长期相结合，土壤次生盐渍化防治才能取得成功。
