1.了解土壤质地：不同质地的土壤(如砂土、壤土、黏土等)具有不同的特性。砂土透气性好，但保水性和保肥性较差;黏土保水性好，但透气性较差;壤土的透气性和保水性较为平衡。
2.判断肥力状况：可以通过土壤检测或观察作物生长情况来大致判断土壤肥力。例如，缺乏养分的土壤可能导致作物生长缓慢、叶片发黄等。
3.选择原料合适的有机肥：
•避免使用重金属含量可能较高的原料，如城市污泥、纸厂纸泥等，以防造成作物污染和收益损失。
•腐植酸类原料对土壤和根系有一定改良作用，但对土壤有益菌支持作用不大，肥料品质一般。
•生化制药厂的固形废弃物经微生物法腐熟处理后制成的有机肥，效果通常较为显著，因其废弃物中的成分营养价值高，且腐熟后易被土壤分解。
4.对于保水性差的砂土，可选择富含有机质、能增强土壤保水性的有机肥。这类有机肥有助于改善土壤结构，增加土壤团聚体，提高土壤保水能力。
5.在黏土中，宜选用能提高土壤透气性的有机肥。有助于改善土壤通气状况，促进根系呼吸和养分吸收。
6.土壤肥力较低时，可选择养分含量相对较高的有机肥。但需注意，不能仅追求有机质含量高，还要考虑其是否容易分解，以便植物吸收利用。
7.种植生长期较长的蔬菜作物(如瓜类、番茄等)时，不单纯使用商品有机肥，可按1:1的比例搭配农家肥，以弥补商品有机肥持效期短的不足。同时，换茬时补充有益微生物也很重要。
8.注意农家肥的使用，如鸡粪等，要关注其中的抗生素、重金属等问题，避免烧根现象的发生。
另外，有条件的话，可以进行土壤检测，以更准确地了解土壤的养分状况、酸碱度、有机质含量等，从而更科学地选择适合的有机肥。同时，也应注意有机肥的腐熟程度，腐熟后的有机肥使用起来更安全，肥效也更好。
