土壤是宝贵的农业自然资源。作物产量的高低、收成的多少，很大程度上取决于农田土壤的肥力。一旦土壤结构、土壤耕作层遭到破坏，土壤质量恶化，作物就如无本之木、无源之水，不仅难以获得高产，而且会降低耕地的使用寿命。只有重视土壤的保护和改良，避免土壤恶化，作物才能高产高效。那么，常见的农田土壤问题有哪些呢?
耕作层变浅
时至今日，我国部分农村地区，还有相当部分农户采用耕牛犁耙耕地，或用马力小的机械耕作，由于长期不进行深耕深松，大部分耕地土壤耕作层较浅，由过去的20～30cm变为15cm左右，加上降雨和灌水沉实等原因，“犁底层”上移及加厚，阻隔土壤水分、养分和空气上下输送，影响作物根系向下生长，土壤保水能力差，抗旱力下降，且土壤有效养分(有机质含量)状况趋于恶化。
土壤有机质含量降低
在农田中，长期缺少农家肥、有机肥的使用，秸秆换田很少进行。一方面，农家肥施用少或不施，不进行秸秆还田(相当多的人还焚烧秸秆)，不种植绿肥，使土壤有机质得不到有效的补充;另一方面大量施用化学肥料，超出土壤负荷高产，频繁的表土耕作，加剧土壤碳的消耗，致使土壤有机质含量减少。土壤有机质减少引发土壤结构破坏和土壤板结，土壤肥力不断下降，理化和生物性质恶化，土壤酸化和次生盐碱化，土传病害发生严重，土壤净化能力减退等。
土壤结构破坏、板结严重
耕地土壤有机质含量偏少，不合理的耕作模式和灌溉方式，化肥施用过多，土壤酸化及盐渍化严重，大大破坏土壤的团粒结构，致使土壤板结，难于耕作。土壤板结使土壤能量和物质平衡遭到破坏，土壤中水、肥、气、热状况失调，最终影响到土壤—植物系统物质转化及能量交换，造成某些生理活动和生命代谢紊乱。
土壤趋于酸化
土壤酸化主要是因为过度使用化学氮肥和生理酸性肥料所致。其中加剧土壤中酸性物质累积，让土壤过度酸化。那土壤酸化会让土壤养分流失，其中有害的重金属活化，有害微生物增加，从而导致土壤病害泛滥和贫瘠化。
土壤次生盐碱化
由于在农业生产中，为了追求高产量，长期过量使用化肥，使得土壤中的盐分不断累积，尤其是硝酸盐类物质过度累积。这些盐分会随着土壤水分蒸发不断积聚到地表面，导致土壤表层次生盐碱化，土壤结构性变差，土壤中微生物种群多样性和功能遭到破坏，影响根系的正常生长，养分吸收少，作物生长不良，甚至出现营养障碍或死亡。
土壤氮磷钾元素比例失调，微量元素缺乏
农民在种植作物的时候，绝大多数缺乏专业农业科学知识。在施肥中不按比例使用，将氮磷肥超量使用，导致土壤中钾元素匮乏。这种长期不给土壤施中微量元素肥料的做法，让土壤中的微量元素枯竭。带来的氮磷钾比例失调，大量元素和微量元素比例失衡。
农田的土壤污染
过量使用化肥、农药、农膜，残留的污染，还有没有专业处理的有机肥污染。将长期残留在土壤中，倘若超出土壤自净能力则会“溢出”。危害农田土壤的环境。破坏土壤生态环境，造成土壤中有益生物、微生物大量死亡。让土壤中生物种群减少，理化生物性质恶化。可以想象到土壤活性降低，功能减弱。
农作物连作造成土壤病
每年耕种同种作物，不实行轮作栽培，连续多年在同一地块上种植同种或同科作物，因为作物根系分泌物和残留物基本相同，病原生物在土壤中积累过多，导致土壤成为有病土壤。多年连作，作物所需的营养元素因连续被吸收而减少，但有的元素在土壤中过剩，致使土壤营养失去平衡。另外，由于土壤有益微生物群落遭到破坏，土壤对有害微生物抑制能力下降，使得有害微生物增多，有益微生物减少，生物性逐渐恶化。
土壤侵蚀
农村耕地中，土壤的侵蚀主要表现在水蚀、风蚀、耕蚀。多数导致这些现象的是因为过度开垦种植导致的。山坡被修整为农田，其中部分坡度在15度以上的坡地，水土流失严重。对开垦后的农田，没有实施有效的保护手段。随意的耕种开垦，不仅造成严重的耕蚀还加剧了严重的风蚀和水蚀。长年累月，土壤过度沙化，保水保肥能力降低。
设施农业土壤综合障碍病
设施栽培是在全年封闭或者季节性封闭环境下实施的，这种高度集约化、高复种指数、高肥料投入、高农药用量、高强度高频度的人为活动。让土壤长期处在高温高湿环境。反复耕种踩踏，土壤健康状态急剧恶化。大致在种植2-3年的时候，土壤就会出现养分失衡，土壤酸化，土壤次生盐碱化，土壤有害物质积累，土壤微生物种群多样性功能性退化等。
土壤得病，作物生长受害。对于已经出现问题或土质较差的土壤来说，不论是土壤改良，还是修复调整，不仅都需要一个较长的过程，而且还要把农业防治、物理防治、生物防治、化学防治等多方面手段综合起来使用，只有这样才能使已经得病或者原生条件比较差的土壤，逐步被改造成适合作物生长发育的良田。
