1、对有机物质的需求
加入到土壤中的富含能量的有机质，包括植物根分泌物，都能促进微生物的生长和活性。根际或其他生物产生的特异氨基酸和其他生长因子促进了细菌和真菌生长。细菌对加入淀粉和单糖等简单化合物反应很快。加入富含纤维素和其他难分解的化合物时，真菌和放线菌会超过其他微生物。如果有机物留在土壤表面(如落叶)，真菌在微生物活性中会占优势。有机物质因蚯蚓、根的活动或耕翻被结合入土壤时，细菌会在土壤中起较大作用。
2、对氧的需求
大多数的土壤微生物是好气的，利用氧气作为其代谢活动的电子受体，另一些原核生物是厌氧的，利用其他物质(如硝酸根、硫酸根电子受体)而非氧气。兼性细菌可以进行好氧或厌氧代谢。在土壤的不同栖息环境三类代谢常同时进行。土壤微生物活性最强的区域位于土壤表层以下几厘米处，氧气浓度高，土壤也不太干燥。
3、对水分和温度的需求
最适宜高等植物的水势(-70~-10千帕)也正适合好气微生物的生长，水分含量过高会限制氧气供应。大多数微生物活性在20~40℃最高。常见的土壤极端温度很少会杀死细菌，过高或过低的温度只能使微生物处于暂停活动状态。除部分嗜冷种类外，温度低于3~5℃后基本停止活动，该温度被称为生物学零度。
4、交换性钙和pH
交换性钙和pH决定某一特定生物能否在特定土壤中生存。大多属细菌可以在土壤任何化学条件下存活，但在钙含量高、pH近中性时，细菌群体数量大，种类多样性高。在强酸性至微碱性范围内，无论其他土壤条件如何，细菌的多样性都会随着土壤pH的增大而升高，较低的pH会让真菌占优势。pH和钙的影响会呈现出：①森林土壤中真菌占优势;②半湿润半干旱草原和牧场，细菌生物量超过土壤真菌。
编者观点：pH和钙的含量对真细菌数量的影响，对于土传病害的防治具有很重要的参考价值。也可以参照以上内容，有针对性的施用各种类型的微生物菌肥，有利于达到有益菌的高峰值。
