原因
(1)耕作制度改变：土壤耕作制度是指耕作方法和耕作次数，目前我国已基本形成以春、秋两季为耕期，冬季进行深耕的耕作制度。其优点是土层较厚、地温稳定，能满足作物根系生长发育的要求，利于保肥、保水，但对土壤结构和通透性影响较大。具体表现为土壤表层板结、耕层变浅。
(2)施用化肥是促进农业增产的重要手段之一，但过量施用化肥，尤其是过量使用氮肥，会导致土壤酸化和板结，影响作物正常生长发育，并造成土壤养分失衡和土壤环境恶化。具体表现为：①土壤板结：由于大量施用氮肥，使土壤团粒结构遭到破坏，进而导致板结;②酸化：在南方地区由于长期大量施用化肥使土壤酸化严重。此外，过量施用氮肥还会导致磷、钾营养元素的大量流失，使土壤养分失衡;③养分失衡：氮、钾比例失调会造成作物生长不正常。
危害
(1)对作物生长发育的影响：过量施肥造成的土壤酸化会影响作物根系的生长发育和光合作用。如根系不发达、吸收养分能力差;根群失水和根系发育不良导致植株矮小，叶片薄而小;根系呼吸受阻;地上部生长减缓等。同时过量施用氮肥还会引起地上部与地下部养分失衡。当根部受到大量氮素的刺激时，会使根毛细胞的活性降低，抑制根的伸长，从而使作物生长缓慢甚至停止生长。当过量施磷时会使作物徒长而影响花芽分化。过量施用钾时会使作物产生“烧苗”现象;过量施用钙时会使作物产生“烂根”现象。
(2)对土壤物理性状的影响：过量施用有机肥和化肥，引起土壤板结、透气性差，从而影响土壤微生物的活性，同时也减少了土壤团粒结构的形成，使土壤保肥保水能力降低。过量施用氮肥，会造成土壤板结、板结加重、透气性变差、通气性能差，从而影响根系生长。
(3)对土壤化学性状的影响：过量施用氮肥、磷肥和钾肥还会导致土壤中氮、磷、钾养分含量不平衡。磷元素容易被固定，钙离子则会降低其有效性。过量施肥造成的土壤酸化还会导致一些微量元素的有效性降低。
(4)对作物病害发生和危害的影响：过量施用氮肥和磷肥造成的土壤酸化还会使部分作物出现病害。如茄果类蔬菜上发生的青枯病和枯萎病，在酸性条件下会加重发生;小麦赤霉病的发生与土壤酸碱度也有一定关系;玉米缺锌时植株矮小，叶片发黄，植株生长缓慢，严重时顶端死亡，生长后期还会出现大量的小粒玉米。同时过量施肥还会影响作物对水分和养分的吸收，导致植株根系发育不良;植株矮化，叶片变小且皱缩，易脱落。
如过量施肥造成的土壤酸化使作物产量降低;过量施氮、磷、钾肥造成的土壤酸化还会使作物品质下降，如果实口感变差，含糖量降低等。
(6)对农业环境和农产品安全的影响：过量施肥造成的土壤酸化还会对农业环境造成不利影响。如导致地下水中硝酸盐含量增加;污染农业用水和灌溉水;降低农产品质量等。
