有机肥的优点是含养分种类多、具有各种大量和微量营养元素的完全肥料，并含有维生素等活性物质，最突出的特点是可以增加、补充土壤有机质。
有机质可改善土壤的理化性状，使土壤耕性变好，渗水能力增强，提高土壤蓄水、保肥、供肥和抗旱防涝能力，增产明显，这是化肥无法做到的。
虽然，有机肥优点这么多，但是单一使用还是行不通的，因为毕竟有机肥里面的大量元素氮磷钾还是很欠缺的，满足不了作物对养分的需求，所以有机肥配施化肥是比较理想的施肥方式。
化肥见效快(只要合理使用)，对农业持续稳产、增产还是很重要的。我们要遵循“以有机肥为主，化肥为辅”的施肥原则，就能实现肥土增产。研究表明，有机肥搭配无机肥好处主要体现在5个方面。
好处一
化肥养份含量高，肥效快，但持续时间短，养分单一，有机肥正好相反，有机肥与化肥混用可取长补短，满足作物各个生长期对养分的需要。
好处二
化肥施入土壤后，有些养份被土壤吸收或固定，降低了养份的有效性。而与农农肥混施后，可以减少化肥与土壤的接触面，减少化肥被土壤固定的几率，提高养份的有效性。
好处三
一般化肥溶解度大，施用后对土壤造成较高的渗透压，影响作物对养份和水份的吸收，增加养份流失的机会。如与有机肥搭配混用，能克服这个弊端，促进作物对养份和水份的吸收。
好处四
如果碱性土壤单一施酸性化肥，铵被植物吸收后，剩下的酸根与土壤中氢离子结合生成酸，会导致酸性增强，土壤板结加剧。如与有机肥搭配混用，能提高土壤的缓冲能力，有效地调节酸碱度，使土壤酸性不至增高。
好处五
因为有机肥是微生物生活的能源，化肥是供给微生物生长发育的无机营养。两者混用能促进微生物的活力，进而促进有机肥的分解。土壤微生物的活动还能产生维生素，生物素，烟碱酸等，增加土壤养份，提高土壤活力，促进作物的生长。
农业农村部副部长张桃林指出，如果用有机肥替代部分化肥，或者让化肥用量减下来，有机肥用量提上去，有机无机配合使用，无论对提高土壤地力还是保护农业环境，还是稳定地提高产量以及农产品的品质，都是一个非常重要的途径。
总之，当前施肥的方向就是有机肥替代部分化肥搭配少量化肥!
