一、土壤有机质是植物和微生物营养物质的主要来源
土壤有机质中含有极为丰富的N、P、S等元素，它们的有机化合物是植物营养物质在土壤中的主要存在形式，并使植物营养元素在土壤中得以保存和聚积。有机质经过微生物的矿质化作用，释放植物营养元素，供给植物和微生物生活的需要。微生物在分解有机质的过程中，取得生命活动所需要的能量，同时产生的二氧化碳供给植物碳素的营养。高等植物亦能直接吸收并同化某些土壤中的简单有机物质，作为植物的直接养料来源。
双手浇灌绿植
二、有机质改良土壤物理性质的作用
(一)促进土壤团粒结构的形成
因为腐殖质是良好的粘结剂，在有电解质，尤其是钙离子存在的条件下，腐殖质产生凝聚作用，使分散的土粒胶结成团聚体，特别是新鲜腐殖质在钙离子的作用下，可形成良好的水稳性团粒，从而可以调节土壤中养分、水分和空气之间的矛盾，创造植物生长发育所需的良好条件。
(二)土壤有机质还可以降低粘土的粘结力，增加砂土的粘结力，改善不良质地土壤的耕作性能。
幼苗在盆中生长
三、腐殖质调节土壤化学性质的作用
腐殖质是一种有机胶体，具有巨大的吸收代换能力和缓冲性能，从而在调节土壤的保肥供肥性能及土壤酸度等方面起着重要的作用。
腐殖质物质所带电性以负电荷为主，吸附的离子主要是阳离子(如钾离子、铵离子、钙离子、镁离子等)，被吸附后则可避免随水流失，而且能随时被根系附近的氢离子或其它阳离子交换出来，供作物吸收，仍不失其有效性。从吸附性阳离子的有效性来看，腐殖物质与粘土矿物的作用一样，但单位质量腐殖物质保存阳离子养分的能力，比矿质胶体大20~30倍。在矿质土壤中腐殖物质对阳离子吸附量的贡献占20%~90%，在保肥力很弱的砂性土壤中腐殖物质的这一作用显得尤为突出。因此，在砂性土壤上增施有机肥以提高其腐殖质含量后，不仅增多了土壤中养料含量，改善了砂土的物理性质，还能提高其保肥能力。
在酸性土壤中，有机质通过与单体铝的复合，降低土壤交换性铝的含量，从而减轻铝的毒害。可以推测，在较低土壤pH的情况下，并没有出现对植物生长不利的影响，这可能与土壤有机质和铝离子的复合作用以及铝有机复合体在土壤中迁移有关。
土壤中磷的有效性低主要是由于土壤对磷具有强烈的固定作用，有机质能降低磷的固定而增加土壤中磷的有效性和提高磷肥的利用率。有机质也能增加土壤微量元素的有效性。
总结：一降(磷的固定)一增(磷的有效性)一提高(磷肥的利用率)。
腐殖酸是一种含有许多酸性功能团的弱酸，所以在提高土壤腐殖物质含量的同时，还提高了土壤对酸碱度变化的缓冲性能。
