焚烧秸秆确实能快速消灭病虫害，杀灭虫卵，理论上也可以给土地增加肥力，增加作物产量，但通过这么多年的事实证明，并没发现焚烧秸秆对粮食有多大的增收效益。反而焚烧秸秆会直接烧死土壤中的有益微生物，影响农作物对土壤养分的充分吸收。而且破坏土壤结构，进而影响农作物的产量。而想要提高土壤肥力改善土壤微环境可以通过其他方法来进行：
1.增施有机肥。通过施用人、畜的粪、尿肥以及堆肥、沤肥、绿肥等手段将有机质含量高的农家肥施入土壤，来增加和保持土壤的有机肥含量，对提高土壤肥力有明显的作用。
2.合理轮作。适当增加豆科作物种植面积，在轮作过程中，四年左右种一茬豆科作物可增加土壤中氮素含量，同时豆科绿肥作物经翻压入土后，大量的根、茎、叶能够增加土壤有机质，改善土壤理化性质，提高土壤肥力。现如今，我们国家正在积极鼓励老百姓种植大豆，农民种植大豆还有专门的补贴。
3.使用土壤改良剂。土壤改良剂可以改善土质，使酸化、盐化、板结、施肥过度土壤恢复活力，改善土壤连作障碍，提供适宜生长的土壤环境，有利于土壤良性循环，提高作物产量，改善品质，减少落花落果，提高结实率，提高土壤保水性，改善土壤吸附性能。
4.用地与养地相结合。这种方法是防止肥力衰退与土壤治理相结合，是保持和提高土壤肥力水平的基本原则。在北方，尤其是垦区，会有部分的休整地，来改良土壤结构，提高土壤肥力。
5.秸秆还田。秸秆中含有大量的新鲜有机物料，在归还于农田之后，经过一段时间的腐解作用，就可以转化成有机质和速效养分。既改善土壤理化性状，也可供应一定的钾等养分。改善了土壤的物理性质，促进土壤团粒结构的形成，增加透气、透水、保肥能力，从而提高土壤肥力。
以上这些方法都可以替代秸秆焚烧来有效的提高土壤肥力。
