果园土壤有机质是果园土壤肥力的重要指标。土壤有机质可直接为果树生长提供相当数量的营养元素和生理活性物质，与果树产量、果实品质密切相关，是果园能否高产、稳产及优质果品生产的基本条件。因此，提高果园土壤有机质含量是提高果园土壤肥力的关键。
土壤有机质不仅可以为果树生长提供营养、增加养分的有效性，保水、保肥及缓冲土壤对酸碱的缓冲能力，还可以促进土壤团粒结构的形成、改善土壤物理性质等。土壤有机质可降低土壤容重，增加孔隙量和通透性，提高土壤贮备、供应和保持水分能力。另外，有机质也有很好的阳离子交换能力，一方面可提高土壤对酸碱变化的缓冲能力;另一方面，腐殖质也可以吸附阴、阳离子，而被吸附的离子，就可避免随水流失。同时，土壤有机质可提高土壤酶活性。
土壤有机质是组成土壤肥力的核心物质，含有果树所需的大量元素N、P、K、S、Ca、Mg及许多微量元素等养分，其含量高低是衡量土壤肥力的重要指标之一，也只有在土壤有机质的作用下，才能形成具有肥力的土壤。土壤有机质可提供植物生长所需95%以上的氮、20%～70%的磷、95%以上的硫。随着有机质的矿质化，营养元素都成为矿质盐类，并以一定的速率不断释放，供果树利用。
有机质是影响果树根系生长发育的重要因子。腐殖质能增强根细胞膜的透性，提高果树对养分的吸收能力，加速细胞分裂，促进根系发育。土壤有机质增加后，果树根系活力增加，根系对养分的吸收和向果实中转移能力加强，也可促进根系生长，使根系在深层土壤中的分布增加，延缓衰老。腐殖质还能提高土壤酶活性，增加果树对养分的吸收能力，从而促进果树生长。另外，腐殖质还含有一些生理活性物质，如胡敏酸、聚酚和醌类物质，刺激果树的生长。
土壤有机质在果树优质高效生产中具有重要作用，提高果园有机质含量不但能实现稳产高产，还可提高果品品质。有机质含量高，则果树生长旺盛、病虫害少，产量高且稳定，品质好。一些研究表明，果园土壤有机质提高后，苹果的果个大，优果率高，且硬度及可溶性固形物含量显著提高，果实去皮硬度增加，苦痘病及皱皮、裂果率降低。相反，有机质缺乏，则果树生长缓慢、化肥利用率低，产量低而不稳，抗逆性差。
