正如国家苹果工程技术研究中心杨杰教授所说:"作物长不好的原因是作物的根不好，作物的根不好是因为土不好，土不好是因为土壤里缺乏大量的有益微生物菌，所以解决当前土壤生态质量和作物产量的当务之急是在土壤中使用优质微生物菌剂。"要使土壤恢复健康，应先知道土壤健康的标准是什么?土壤的组成是固相、液相、气相三类物质，主要包括矿物质、有机质、水分、空气和微生物。土壤中这三类物质互相联系、互相制约，是具有一定结构的有机整体。因此，土壤健康的标准也由这三类物质进行界定:健康的土壤中包括45%左右的矿物质、25%左右的空气、25%左右的水、5%左右的有机质和1%左右的微生物。
前不久，中央电视台播出了《被化肥"喂瘦"了的耕地》专题调查，报道再次指出了由于长期使用化学肥料，我国的土壤已经不再"健康"，土壤性状恶化、土地板结、土壤酸化、盐渍化、土壤微生物多样性被破坏等问题越来越突出，并直接导致了土壤贫瘠、地力衰竭等影响农业可持续发展。
在土壤生态如此恶劣的形势下，相关专家建议，向土壤中施入微生物菌对于改良土壤、提升地力、改善土壤生态环境、提高农作物产量和品质具有极其重要的作用。
微生物菌剂为何能使土壤"药到病除，恢复健康"?
首先，微生物菌是真正意义上的土壤的"造就师"。
微生物通过代谢过程中氧气和二氧化碳的交换以及分泌的有机酸等酸性物质，促进土壤中微量元素的释放及螯合，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况，促进有机质、腐殖酸和腐殖质的生成。对应于当前土壤中出现的通透性不强、保水保肥性差、地力差等问题，正是受土壤中的团粒结构、有机质、腐殖酸和腐殖质的影响，而这些物质的形成又受土壤中微生物的作用。
其次，微生物菌是土壤的"养分转化师"。
微生物在土壤中物质和能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，是物质循环链上的重要环节。它能够活化土壤有机与无机养分，分解有机物，释放养分，增加养分的有效性。对应于当前土壤中出现的板结、酸化、盐渍化、土壤贫瘠、地力衰竭等问题，这些问题出现的原因是肥料在土壤中长期积累、残存、得不到有效分解和营养转化，养分的释放和转化正是靠微生物。正如《被化肥"喂瘦"了的耕地》节目中农户所说，原本用50公斤的化肥现在已经用到了100公斤甚至150公斤，粮食仍然不增产，原因就在这里。
再者，微生物菌是土壤的"清洁师"。
微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、有机农药、重金属和其他污染物等，在其理化反应中对上述污染物质进行分解、转化、固定、转移以及新的无害化合成，把他们分解成低害甚至无害的物质，降低土壤污染的程度。
此外，土壤中的微生物，例如抗生性微生物，它们能够分泌抗生素，抑制病原微生物的繁殖，这样就可以防治和减少土壤中土传微生物对作物的危害，提高作物品质和产量。
微生物是土壤的重要组成部分并且是土壤生态系统的灵魂和中心，必将在土壤健康的恢复中发挥重要作用。
随着土壤酸化和板结问题日趋严重，微生物被受到普遍关注，各种各样的微生物肥料也被广泛应用。那么，微生物肥料在土壤中究竟起到什么作用呢?有关专家认为，微生物肥料在土壤中主要有五个重要身份
一是土壤的"造就师"。
微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，与植物粘液、矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况，促进有机质、腐殖酸和腐殖质的生成。
二是"养分转换师"。
微生物在土壤中物质和能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，是物质循环链上的重要环节。它能够活化土壤有机与无机养分，分解有机物，释放养分，增加养分的有效性。
三是土壤的"清洁师"。
微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、有机农药、重金属和其他污染物等，在其理化反应中对上述污染物质进行分解、转化、固定、转移以及新的无害化合成，把他们分解成低害甚至无害的物质，从而降低土壤污染的程度。
四是土壤的"治疗师"。
土壤中的微生物，例如抗生性微生物，它们能够分泌抗生素，抑制病原微生物的繁殖，这样就可以防治和减少土壤中土传病害微生物对作物的危害，提高作物产量和品质。对土壤进行"解毒"和"保健"，调控和维护土壤的健康质量。
五是土壤的"营养师"。
微生物肥料具有解磷、解钾、固氮的作用，促进土壤中微量元素的释放及螯合，可提高肥料利用率10%~30%。在一定的条件下，还能参与腐殖质形成，有利于提高土壤肥力。
