近年来，湖北恩施州多措并举狠抓农业面源污染治理，确保土壤质量安全，农业可持续发展支撑力不断提升。在土壤酸化治理、化肥农药使用、农作物秸秆综合利用、生态农业生产发展等方面取得成效。
2014年，恩施州委、州政府实施“山更青、水更绿、天更蓝、土更净、城乡更美”五大专项治理行动以来，全州农业部门紧紧围绕“土更净”专项治理部署要求。土壤酸化治理成效显著。2015—2017年，恩施州政府连续三年每年投入500万元专项资金用于耕地土壤酸化治理，到2017年底，100万亩强酸性土壤治理任务基本完成。治理后亩产水稻增收5.7%至10.3%，玉米增收8.8%至12.7%，马铃薯增收8.2%至12.6%，蔬菜增收4.2%至10.4%，水果增收5.3%至11.2%，烟叶增收4.4%至8.9%。
化肥农药使用量明显减少。2017年，全州化肥使用总量27.36万吨，比2015年减少3.65%，亩均用量减少2.2公斤，减量3.64%;农药使用总量1376吨，比2015年减少11.74%，亩均减量11.73%，预计到2020年完全可以实现全州化肥使用总量零增长、农药使用总量减少30%以上目标。
农作物秸秆综合利用有力推进。目前，全州大力推进以农作物秸秆肥料化、饲料化、基料化和能源化为重点的农作物秸秆综合利用工作，有效地解决了秸秆去向的问题。
农业生产不断向绿色、循环利用发展。到2017年底，全州通过农业部认证的“三品一标”企业136家，认证产品274个;其中绿色食品标志企业71家，产品175个;有机食品标志企业30家，产品60个;无公害食品标志企业27家，产品31个;地理标志农产品企业8家，产品8个。全州户用沼气池56.2万户，小沼工程700余处，大型沼气工程10处，形成了经济、生态、社会三大效益同时显现的生态能源产业链。
