土壤中的有机质主要是生长在地面上的植物残余物形成的或者人为施用各种有机物，它与土壤肥力有密切的关系。土壤有机质可以分类两大类：一是新鲜有机物，与活的有机物无区别，只是没有生长机能;二是腐殖质，即有机体残余物经土壤微生物分解以后形成的物质。
一般柑桔优质高产稳产园土壤有机质含量应在3~5%以上，而我国柑桔园土壤有机质大部分只有1~2%。土壤有机质含量高，有利于柑桔生长和结果，土壤有机质的作用在于：
(1)对土壤物理化学性质有很大的影响，土壤团粒结构、透水性、持水量、通气、吸收量以及缓冲性都决定土壤有机质;
(2)它含有无数微生物活体，同时也是微生物的养分和能量的来源;
(3)分解有机物逐步释放各种元素及安全养分;
(4)腐殖质酸向土壤溶液、土壤空气和大气供应二氧化碳;有利于养分的合成。
(5)有机酸在很大程度上影响母质的化学风化过程，可加强磷、铝、钾、镁等化合物从难溶性矿物的成分转移到土壤溶液中，容易被根系吸收。因此，柑桔园土壤管理应该做到使土壤有机质含量逐年增长。
