施用土壤消毒剂前精细整地在蔬菜拔园后立即运到棚外，放在远离棚室的地方集中销毁。在施用土壤消毒剂前，先进行深翻(约30厘米)，再用旋耕机旋地，使土壤颗粒细小而均匀。这样在一定程度上能充分发挥土壤消毒剂的效果。注意，土壤消毒剂要在腐熟粪肥施用后施用，同时增施生物菌肥。
保持适宜的土壤湿度消毒时土壤湿度应保持在60%~70%。如遇连续晴天，湿度达不到60%，就需要提前浇地。浇地后3~4天(湿度以手捏成团、1米高处落地能散开为标准)，各种病原菌及根结线虫对药剂处于敏感状态，杂草种子准备萌芽，更容易被土壤消毒剂杀死。
正确覆盖塑料薄膜施用土壤消毒剂后覆盖的塑料薄膜不能太薄，最好用无透膜(不透气)或厚度在0.04毫米以上的塑料薄膜。塑料薄膜四边要压好，注意不能有破损，最好用新膜，以防止漏气而降低消毒效果。从旋耕到覆膜最好在2~3小时完成。
保持一定的覆膜时间施药后覆膜时间长短依温度而定，温度在30℃以上时，覆盖7~12天;温度在15℃~30℃时，覆盖12~15天。当覆盖时间达到上述要求天数时，可揭去薄膜，按照同一深度(30厘米)进行松土，确保充分透气一周以上，保证药剂无残留再进行定植。
