微生物农药是生物农药的主要组成部分和重点研究方向，其开发与应用在生态农业中扮演着核心的角色。微生物农药发展被寄予重任，业内人士预计短期内我国微生物农药将取代20％以上的化学农药。
目前我国微生物农药利好因素频现。主要体现在以下三点：
一是高毒农药禁用力度不断加强，7月初，农业部宣布禁用22种高毒农药，其中2011年底前将禁用和淘汰其中的苯线磷等10种高毒农药，上述农药年产量约为5万吨，市场空缺将需要高效低毒农药补充。
二是近年来食品安全问题频发，引起对现行的农药残留标准全面修改与更新，许多地区鼓励和补贴使用生物农药。
三是新出台的农药“十二五”规划和6月开始执行的《产业结构调整指导目录（2011年本）》均明确指出鼓励发展生物农药。
目前我国微生物农药在开发、生产和应用等多个方面与发达国家和地区差距较大，与现代农业发展要求相比也有很大距离，今后应多头并举促进发展。具体措施探讨如下：
一、主流品种加快技术提升。
苏云金芽孢杆菌（Bt）是目前微生物杀虫剂产量最大的品种，它利用基因点突变改变蛋白质结构以改良毒蛋白的活性。其今后开发的重点包括：开发出新的强毒力的毒素基因；开发多毒蛋白基因Bt菌株；开发多种增效剂及与化学农药混配制剂等，从而克服病虫抗性增强、杀虫谱窄、持效期短等缺点。农用抗生素主要品种井冈霉素、浏阳霉素、阿维菌素等。应重点解决其菌种选育和基因工程改造、发酵过程优化、“三废”治理、衍生物和混配高效品种的开发等。真菌杀虫剂主要品种有白僵菌，应通过释放毒力因子、增加毒性基因拷贝数以及从其他微生物引人毒性基因来增强菌株毒力或扩大寄生范围。同时应借鉴化工通用新技术，建立和完善白僵菌高效工业化生产技术体系。
二、应加快新品种创制与应用。
随着化学工业多年发展，化学农药新结构化合物设计与开发越来越难，成本随之增加，而微生物农药利用丰富生物资源筛选与开发的相对费用较低。近年来，国外新型微生物农药登记方兴未艾，因此我国应加快新品种的开发。对于不同品种来说，细菌类杀虫剂进行新菌种筛选；真菌杀虫剂应深入杀虫基因和致病机理研究，寻找新的杀虫基因；病毒杀虫剂应利用基因工程技术进行基因重组；微生物杀菌剂应从农用抗生素的开发、研制扩展到在微生物中筛选杀虫、除草、抗病毒和植物生长调节剂等生理活性物质的研究。值得一提的是，目前我国尚没有真正应用的微生物除草剂，应借鉴国外发展经验，重点研究一类利用放线菌生产的抗生素除草剂，另一类是利用病原真菌生产的孢子除草剂。
三、要强化宣传推广和寻求政策支持。
目前微生物农药重研发轻宣传推广，因此许多品种开发出来后市场应用较少。我们应借鉴国外跨国公司新型农药的推广模式，并利用食品安全和有机生态农业等概念造势，让市场认知和接受微生物农药。此外在寻求相关政策支持方面，微生物农药环保低碳，应享受国家相关节能减排优惠政策，国家各项科技奖励基金对于微生物农药应偏重于传统农药。在应用推广方面，微生物农药要通过建立示范试验区、生态有机农业园等多种方面寻求当地政府财政支持与补贴。
四、须高度重视高效应用过程的完善。
微生物农药的特性有见效慢、质量不稳定和受环境因素影响较大等，因此如何高效应用成为微生物农药发展中重要一环。生产及流通环节应充分了解微生物农药生物特性，明确药剂的作用机理，科学掌握用药温度、时间和施用方法等。只要在实际应用中让农民意识到微生物农药的好处，市场之门就自然打开。
