由于氟原子的特殊结构，在农药等领域中展现出良好的特性。据不完全统计，近10年来国际上新开发的86种化学农药中，含氟化合物有34种之多。含氟农药已经成为高端品种和新农药创制主体，许多含氟农药具有良好应用前景和较高附加值，尤其值得关注是一些专利或行政保护过期不久或即将过期的一些重要含氟农药。以下简要介绍部分值得大力发展的品种。
溴虫腈，商品名除尽，国内专利2008年到期，年销售额超过1亿美元。作为新型吡咯类广谱杀虫杀螨剂，它可以防治多种鳞翅目、双翅目、鞘翅目、半翅目害虫和螨类，并可有效控制对氨基甲酸酯类、有机磷类和拟除虫菊酯类杀虫剂产生抗性的昆虫。国内龙灯化学和广东德利生物科技公司登记原药生产，其中间体为2-（对氯苯基）-5-（三氟甲基）吡咯-3-腈，国内拥有成熟的工业化技术。
四氟苯菊酯，商品名拜奥灵，国内专利2008年到期。它是一种高效、低毒的卫生用拟除虫菊酯杀虫剂，具有吸入、触杀和驱避活性，用作多种蚊香、驱蚊片的原料，也可以有效防治苍蝇、蟑螂和白粉虱，是目前国外主流的卫生杀虫剂品种，目前国内市场价格约为60万元/吨（折百）。四氟苯菊酯的生产企业较少，主要是其中间体四氟苄醇合成技术难度较大，比较符合国情的合成路线是以四氟对苯二甲腈经过水解、脱羧得到四氟苯甲酸后还原得到四氟苄醇。
氰氟草酯，商品名千金，无中国专利，国内2007年行政保护到期，陶氏益农开发的新型苯氧羧酸类除草剂。它是我国目前水稻田除草剂最主流品种之一，成为近年来国内登记热门品种之一。氰氟草酯所需中间体为34-二氟苯腈，文献报道合成路线较多，其中以以34-二氯苯甲酸为原料，将羧基与尿素在高温下脱水变成氰基，然后直接氟化得到34-二氟苯腈是比较适合国情的工业化路线。
噻氟菌胺，商品名宝穗，国内2010年行政保护到期，可防治多种植物病害，特别是担子菌丝核菌属真菌所引起的病害。它是目前防治水稻、花生、棉花、甜菜、马铃薯和草坪等多种作物病害的优秀杀菌剂。合成噻氟菌胺所需中间体为对三氟甲氧基苯胺，该中间体还可以合成重量级杀虫剂茚虫威，茚虫威国内专利2011年底到期。该中间体以三氟甲氧基苯为原料经过硝化和还原工业化合成路线相对成熟和适合国情。
氟啶酰菌胺，商品名为Volare或R6Albis，是一种新型酰胺类内吸性杀菌剂，专利公开日1999年8月26日，2005年在中国获得首次批准。它用于马铃薯防治晚疫病，其最引人注目的是其对作物非常安全，特别适宜于有害生物综合治理体系，近年来全球销售额快速增长，成为引人瞩目的新型杀菌剂品种。合成所需中间体为23-二氯-5-三氟甲基吡啶，该化合物是众多含氟农药的通用中间体，如吡氟氯禾灵、定虫隆、啶蜱脲、吡虫隆和国内专利刚到期的杀虫剂氟啶胺。目前比较适合国情的路线是以2-氯-5-甲基吡啶为原料，经过侧链氯化、环氯化、氟化得到。
