1972年我国首个开发的农药杀菌剂是多菌灵，在防治小麦赤霉病方面取得了令人满意的效果。自上世纪90年代起，国内农药界正式迈入自主开创农药产品行列，到目前为止创制的农药品种有50多个，其中不少创制的农药是杀菌剂品种，约有20多个。
1994年由沈阳化工研究院第一个自主创制的农药品种是杀菌剂氟吗啉，它隶属于丙烯酰胺类杀菌剂;然后国内相继创制开发许多新颖的杀菌剂农药产品，如丁吡吗啉、唑菌酯、丁香菌酯、苯醚菌酯、唑胺菌酯、氟菌螨酯、氯啶菌酯、烯肟菌酯、烯肟菌胺等。其中，唑菌酯、丁香菌酯、苯醚菌酯、唑胺菌酯、氟菌螨酯、氯啶菌酯、烯肟菌酯、烯肟菌胺等产品隶属于strobilurin类杀菌剂中的甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂。
所谓strobilurins类杀菌剂是以天然抗生素strobilurin A为先导化合物开发的一类新型杀菌剂。它们的出现克服了strobilurins A见光易分解和难于商品化的缺点，保留了先导化合物中活性基团β-甲氧基丙烯酸酯，通过交换与双键结合的苯基、嘧啶基等基团，从而提高化合物的渗透性。其作用机理是对植物病原菌有电子传递抑制作用，并对螨类呼吸链也具有相同水平的电子传递抑制作用;由于创制的甲氧基丙烯酸酯药效活性基团占据strobilurins类杀菌剂的主导地位，因此这类杀菌剂常称为甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂。
除此之外，国内创制的杀菌剂中还有不少其他类型的药效活性基团，如氰基丙烯酸酯类、丙烯酰胺类、吡啶噁唑啉类、噻唑类、农抗类、生物碱有机酸盐、环己酮磺酰类、噻二唑酰胺类、吩嗪类、有机磷类、寡聚糖类等，从而创制出不少新的杀菌剂品种。新创制的杀菌剂品种见表1所示。
除了表1所列之外，国内还有一些创制的农药杀菌剂品种有：噻菌铜(Thiodiazole-copper，噻唑类化合物，浙江龙湾);菲啶毒清(NK-007，生物碱有机酸盐，南开大学);申嗪霉素(Meperfluthrin/M18，吩嗪类，上海交通大学);金核霉素(aureonucleomycin，农抗类，上海农药研究所);长川霉素(ascomycin，农抗类，上海农药研究所);氟苯醚酰胺(华中师范大学);中科(3号Zhongke 3 hao和中科6号Zhongke 3 hao，寡聚糖类，大连化物所)等。
备注：沈阳院—沈阳化工研究院，浙江院—浙江化工研究院，江苏所—江苏农药研究所，中农科院等—中国农业科学院植物保护研究所、中国农业大学和江苏耕耘化学有限公司联合研究开发创制，中农大—中国农业大学。
就目前创制开发的杀菌剂产品，其中以2007年底登记的氰烯菌酯，2014年其销售额已达到0.82亿元，占据国内创制杀菌剂农药产品的首位，同时名列创制农药品种的第二位(第一位是扬农的杀虫剂氯氟醚菊酯，2012年销售额1.07亿元)，其余创制的农药杀菌剂产品销售额还比较小。
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