目前的中国农机市场是一个对全球开放的市场，约翰迪尔、久保田等外资企业在中国快速全面布局，占据了中国农机行业的大半市场。面对这种局面，作为为数不多的国有农机企业之一，中国农机院始终不忘“国”字头科研机构的责任担当，在国家技术创新体系中勇担重任。中国农机院有国家实验室、国家工程机械中心，以此为依托构建了“四位一体”的创新体系，其科研范围包含了田间作业、作物收获、节水灌溉和排灌、农产品加工和可再生能源利用、农业设施与机电自动化，以及畜牧业装备等领域。目前行业80%以上的在用产品技术均源于中国农机院，而中国农机院在行业技术服务的比例，也占到全行业规模以上企业的18.3%。与此同时，农机院在争取把这些国家级的平台再进一步融合建成国家的重大科技创新基地，以此来引领整个行业的科技创新。从技术创新储备和为中国整个农机行业服务这个角度来说，中国农机院作为仅有的两个国有大型农机企业之一（另一个是一拖）已当之无愧成为中国农机行业的“创新旗舰”。
布局产业，要做高端制造
2009年，中国农机院重组进入国机集团，李树君成为农机院院长。作为掌门人，他提出了要搞高端规模化先进制造的问题，真正要与国际大企业接轨。上任伊始，在农机院产值只有18亿元时，他就大胆提出，要在“十二五”期间实现产值100亿元，2012年中国农机院实现产值45亿元。
李树君解释说：“搞制造、搞生产和搞规模化制造和规模化生产是不一样的，国内一拖那是规模化生产，我们原来搞的那种生产最多是解决一个有没有场地的问题，我觉得我们最近这三年是真正的要转变一个要不要搞高端规模化制造的问题，要不要搞信息化的问题。我们每年要拿出1000万元来做信息化，全国二十几个单位、十几个制造基地，所有的财务、所有的供应链、供应商包括它的销售商，货去哪了都非常清楚，这样我们真正做到了与国际接轨。”
如今，农机院已形成了贯穿东西南北中的产业格局，在全国有12个制造基地，包括华东地区以湖州、株洲为中心的水田农业机械产业基地，西南地区以重庆为中心的可再生能源装备产业基地，东北地区以长春为中心的规模化农业机械产业基地和农机物流科技园，西北地区以呼和浩特为中心的畜牧业机械产业基地、以乌鲁木齐为中心辐射中北亚的农业装备产业基地，中部地区以河北固安为中心的农产品加工与包装机械产业基地、以河北涞水和固安为中心的旱作农业机械产业基地、以河南洛阳为中心的收获机械规模化产业基地以及以北京顺义和通州为中心的军工与特种装备产业基地。此外，还有以试验、示范为主的海拉尔草原畜牧机械制造与试验基地和北京小王庄农业装备综合试验示范基地。
有了制造基地，农机院不但要制造技术含量高还要在价格上让农民能接受的高端农机。李树君举了个水稻收割机研发制造的例子，这种机械是非常复杂的，有4000多个零件，最早是日本久保田制造引进中国，卖36万一台。农机院（属于自己的知识产权）研究做出来以后，久保田就降价卖32万元，现在是卖22万元左右，而农机院同样的机器只卖16~18万元。
作为现代农业工程技术装备“引领者”，目前，中国农机院除了可以提供三大粮食作物的全程机械化装备，还可以提供畜牧业全程工程设备、食品加工工程设备和可再生能源工程设备，真正成了从田间到餐桌全产业链的工程技术解决方案提供者。
做大做强中国农机企业一直是李树君追求的梦想。以李树君为首的一班院领导为农机院定出发展方向：中国农机院首先要实现规模化、高端化和专业化，这是做大做强的有效手段，其次是要转变成高技术含量、高附加值和高端制造的现代化“三高”制造企业，最终在未来5~10年，将中国农机院打造成为一个以自主创新为驱动力，以高端制造为主体，集科工贸为一体的国内领先、国际一流的现代化跨国企业集团。
李树君告诉记者：“我们要创造‘双百企业’。”即打造百亿级企业，塑造百年企业文化，让企业生命之树长青。
