据新疆自治区发改委近日发布的《新疆维吾尔自治区农业产业化发展第十一个五年规划》显示，在“十一五”期间，新疆将以建设全国最大的棉花基发为目标，大力推进棉花基地建设。以建设全国最大的棉花基地为目标，提高单产和品质，发展多类型棉花，满足市场需求。
棉花的区划布局充分依靠科技进步，以提高市场竞争力和应变能力为目标，以提高品质和发展多类型棉花为突破口，以转换流通体制为保证，坚持“稳定面积、主攻品种、调整结构、改进质量、降低成本、提高效益”的指导方针，建设优质高产的出口棉基地，占领国内优质棉市场，积极参与国际棉花市场竞争。发展棉短绒、棉籽蛋白等棉副产品加工业，延长棉花产业链，增加棉花综合效益。
同时，巩固和发展棉花产业，坚持优质棉基地建设与西部大开发战略和农业产业结构调整相结合的原则，面向国际市场和国内棉花市场，大力实施技术创新，采用常规技术与高新技术相结合，棉花生产与管理机制创新相结合，优质棉基地建设与流通体制创新和我国棉纺工业发展相结合的原则，坚持走优质、高产、低成本的发展路子。发展的战略方向是：重点开发精梳棉、棉短绒、棉浆板、棉籽油深加工、棉蛋白等。
继续建设“十一五”优质棉基地项目，重点建设种子工程和技术综合服务体系，力求全面提高新疆棉花生产和综合竞争力。其中种子工程建设是围绕健全种子产业体系，建设良种繁育田60万亩，配套完成三级种子生产体系48个。技术综合服务体系建设是进一步配套完善技术综合服务体系的基础条件，建设技术综合服务站点54个，农机社会化服务站点10个。实施步骤为2006-2010年：每个基地每年投入100万元，5年内逐步建成，48个基地共需投入24000万元。
在棉花加工方面，棉纺织工业是该区经济的支柱产业。以优质棉纱、棉布为主，重点开发中高档纯棉纺织、天然彩色棉纺织、棉短绒深加工生产高级漂白浆板等深加工产品。在北疆，重点以新疆天山纺织工业园区为中心，建立纺织基地，尽快形成100万锭生产规模；在南疆，重点以西尼尔纺织工业园区为中心，建立纺织工业基地，形成100万锭生产规模。重点项目有新疆天山纺织(集团)有限公司建设的《20万锭棉纺精梳生产示范项目》；巴州泰昌实业有限责任公司建设的《6万锭高支精梳股线生产线项目》等。
