2009年6月1日，农业部正式启动了信息公开电子监察系统，通过电子化手段实现对整个部机关印发文件公开情况的全过程监督，进一步提高信息公开的全面性、及时性和准确性，为切实保障公民、法人和其他组织的知情权提供了有力支撑，使信息公开工作的制度化、规范化水平迈上了新台阶。
建设信息公开电子监察系统，提高农业部信息公开工作水平，是农业部党组《关于创新体制机制促进农业农村经济科学发展工作方案》和《贯彻落实〈建立健全惩治和预防腐败体系2008―2012年工作规划〉的实施办法》提出的明确要求。针对信息公开工作目前普遍存在的管理难、监督难问题，农业部在深入调研的基础上，结合自身工作特点，专门研究制定了《农业部信息公开电子监察管理暂行办法》，通过开发信息公开电子监察系统，将应公开信息的公开过程纳入电子时限管理，将监察是否存在应公开未公开信息纳入常态化管理，依托信息公开电子监察系统的信息采集、预警提醒、数据汇总、统计分析等四大功能，有效地实现了对信息公开工作的全方位、全过程、全天候管理和服务。该系统对应公开发文的实际公开过程实行绿、黄、橙、红四色标记，绿色表示正常运行，黄色表示进入预警状态（提前5个工作日），橙色表示当天预警，红色表示超时警示。各司局通过电子监察系统，能够及时掌握本司局信息公开情况，做到“提前预警、限时办结”，确保政府信息该公开的必须公开，并在时限要求内及时公开。
农业部信息公开电子监察系统的启动实施，标志着农业部信息公开工作制度更加健全，监督管理更加完善，以公开带服务、以公开推改革、以公开促发展的能力进一步增强。
