在水稻的起源与进化史上关于糯稻的进化以及对文化的影响问题还有很多迷团没有被揭开。其中的核心问题是糯稻和非糯性稻农耕的起源哪个在先的问题。从民族以及民俗学上看，在我国古代文化以及现在居住在我国西南地区的很多少数民族给糯稻赋予了太多的文化内涵。我国古代祭祀上的供品都是糯稻以及糯稻制品，如粢、糈为祭祀用的糯米，而醴是祭祀时献给神或祖先的糯米甜酒。另外，我国西南地区的很多少数民族如侗族、苗族、傣族、水族等在节日时都吃用植物染料染过色的糯米饭，节日时还打糍粑；侗族、壮族、水族等民族的传统文化中，糯稻的稻穗或穗梗具有辟邪、驱鬼的作用；有些少数民族村寨还保留着以糯米为主食的饮食传统。在我国西南地区存在明显的糯稻饮食文化圈；围绕着水稻生产举行的各种祭祀仪式中，与糯稻相关的祭祀内容远比非糯性水稻丰富。
人类的各种文化现象是在漫长的历史长河中，通过人类年复一年的循环重复活动刻画到人类的记忆中而形成的烙印。所以，就农作物而言，人类对某一种作物的接触时间越长关于这一作物的文化记忆就越深刻，相关文化现象就越丰富。典型例子：居住在云南孟连县芒信乡的傣族人一年种植两季水稻，第一季种杂交稻，第二季种植常规水稻，包括糯稻。他们在种植杂交稻时没有任何与水稻生产有关的祭祀仪式，但是在插第二季秧苗时举行隆重的祭祀仪式。对于傣族人来讲，杂交稻只是粮食而已，但是，糯稻对他们来讲就是自己的文化本身。另外，玉米对美洲以及南美洲的原住民来说就是他们的文化，但在世界其他地方玉米就是一种粮食或者说商品。同样，作为亚洲文化符号之一的水稻在世界其他地区，如在美国或在欧洲种植时水稻就是一种粮食或商品。
很明显，从文化人类学的角度来看，人类认识糯稻的时间应该早于非糯性水稻，也就是说水稻农耕起源于糯稻。但是，这一观点在生物学上无法解释。比如，到目前为止在野生稻里没有发现糯性野生稻，那么，人类在早期驯化野生稻而进入原始稻作农耕时不可能从糯稻开始。而且，糯性对非糯性而言是隐性基因，就算远古时代野生稻里已经出现纯合的糯性隐性基因，但是处于采集社会向原始农耕社会过渡时期的人类不可能发现并选择野生稻的糯性变异。所以，从生物学角度来看，水稻农耕应该从非糯性野生稻的驯化开始。另外，考古挖掘中发现的新石器时代稻谷遗存都是炭化物，无法确认其胚乳淀粉的结构，也就是说无法辨认这些古代的稻谷到底是糯稻还秥稻。如果能研究出鉴别炭化稻谷淀粉结构的实验方法的话也许能揭开水稻进化史上的这一千古难题。
根据上述背景，就水稻农耕的起源、进化与糯稻文化的关系可以提出以下几种假说：1）水稻农耕文化起源于糯稻，也就是说，我们的祖先在驯化野生稻的过程中发现并选择了糯稻。这样就可以解释糯稻所承载的诸多文化现象；2）水稻农耕文化起源于非糯性野生稻的驯化与栽培，后来当水稻农耕达到一定水平的历史阶段我们的祖先发现并选择了纯合的野生稻变异体。因为糯稻在外观（糯稻的胚乳为乳白色而非糯性大米的胚乳为半透明的白色）、口感（粘性）以及耐饥饿等特点，得到人们的喜爱，进而把糯稻视为珍品，所以开始大量耕种糯稻。从民俗学上看，所有的民族都在祭祀神和祖先时拿出他们认为最好的东西来敬献，另外，在节日或招待贵客时也拿出最好的食品，所以人们把他们最珍贵的糯米作为祭祀的供品献给祖先和神灵是很自然的事情。糯米就这样被赋予了很多传统文化的内涵，也就成了稻作文化的一个重要符号。
