大豆根部病虫害主要有孢囊线虫病、根腐病、根潜蝇、黑绒金龟甲、地老虎等，防治方法如下：
农艺措施：搞好大豆品种更换，避免长期种植单一品种，提高大豆自身的抗病，耐虫能力；提倡机械化选种，以清除病粒、虫食粒、杂草籽、杂质，减少病虫侵害机会；适期播种，依据各地病虫害发生情况；采取早播或延后播种的方法达到躲病避虫的目的；及早耕翻，精细整地，尽量清除病残体，减少害虫越冬几率。
化学防治对孢囊线虫和根蛆重的地块采取5%甲拌磷(Ⅱ)，配合“三垄栽培”播种方式随种肥下地；还可采用种衣剂，农药为1∶75比例包衣。35%甲基硫环磷、35%乙基硫环磷，按种子量0.5%拌种，其中应用5%甲拌磷还可兼治二条叶甲、蓟马、红蜘蛛等苗期害虫。大豆黑绒金龟甲、地老虎亦可应用上述方法；在根腐病重的地块，采用50%多福合剂，按种子量0.5%拌种；在根部病虫害混发区，可采取杀虫剂、杀菌剂混合拌种。
