小麦（2554，-2.00，-0.08%）全蚀病的病菌主要来源于残存在土壤里的带菌根茬以及混杂有病根、病茎、病叶鞘等残体的粪肥、种子三种途径。因此，控制病害必须做到保护无病区，封锁零星病区，压低老病区病情；因地制宜，实行轮作倒茬，增施有机肥、磷钾肥，选用耐病丰产品种，深翻倒土；辅助于药剂拌种是防病的重要措施。
1 轮作倒茬
全蚀病随寄主作物复种指数和连作次数的增加逐年加重，而与非寄主作物(如蔬菜、棉花(19515,-60.00,-0.31%)、葱蒜等)轮作1~2年的麦田(微博)，病情明显减轻。采用重病田大轮作，轻病田小换茬。具体是重病田种植小麦1年以上，改种蔬菜、棉花、油菜等作物；轻病田小麦收获后，复种花生、大豆(4825,-33.00,-0.68%)、葱、白菜、萝卜等非寄主作物。
2 坚持五改
2.1 改低茬收割为高茬收割 全蚀病病菌侵染部位仅限于小麦根部和茎基部15cm以下。高茬收割可有效控制种子间残体带菌。收割后及时清除田间麦茬，集中处理；
2.2 改常温沤肥为高温发酵灭菌沤肥 由于常温沤肥不能使病菌死亡，将大量病菌带入田间，扩大发病面积。而经高温发酵灭菌处理后的粪肥，病菌存活率为0。高温发酵灭菌方法：在“大暑”前后，把麦糠与水拌均，堆在平地上，堆高2~3m，长宽不限，表面加盖塑料(9920,-390.00,-3.78%)薄膜，经1~2天，堆温可达50℃以上，发酵3天后即可拆垛用于基肥，扒垛时，将四周及堆底半尺厚发酵温度不足40℃的麦糠扒开，重新堆积发酵。
2.3 改自留种为购良种 麦田病麦与无病麦混合收割脱粒时，种子间夹带大量病体残屑。而正规种子生产部门生产的良种，经严格精选，无杂质，杜绝了病菌传播。
2.4 改浅耕为深翻 实践证明，深翻50~60cm可使小麦全蚀病白穗率降低80％以上，深翻后，需增施有机肥提高土壤肥力。
2.5 改单一施肥为配方施肥 合理搭配肥料，培肥地力，促进小麦健壮生长也是防治该病的一项重要措施。
3 增施有机净化肥 麦田严禁施用未经高温处理土粪、麦糠、秸秆等，防止病菌随土粪扩散。
4 药剂处理
4.1 土壤处理播前可使用70％甲基托布津每亩2~3kg加细土20~30kg均匀施入播种行间处理土壤。
4.2 药剂拌种可选用3％敌萎丹400~600ml拌种子100kg或2.5％适乐时200m1拌种子100kg有较好防效。
4.3 灌根小麦返青期，施用蚀敌或消蚀灵每667m2100~1500ml对水150kg灌根。
