杏树颈腐病的发生，不仅影响产量，造成杏树的死亡，而且严重的影响到杏树的生产发展。杏树颈腐病主要发生在杏树的主干基部，是由一种真菌引起的病害。病菌以卵孢子在土壤中越冬，到春季卵孢子便侵入杏树枝干，也可以由卵孢子萌发后产生孢子囊后直接侵入。
防治杏树颈腐病要注意以下几点：
杏树感染颈腐病后，病部皮层变褐色并腐烂，下陷呈绞缢状，病部无异味，在病部相对应的地上部，枝干表现发芽迟、生长弱、如不及时治疗，叶片将萎蔫、干枯以至植株死亡。
杏颈腐病一般易发生在土质粘重、土壤排水不良或由于间作蔬菜灌水过多，以及杂草丛生管理粗放的果园。主干颈部有伤口或嫁接口较低埋入土中，也容易感染此病。春季和夏季降雨多的好的沙壤土，如果新建的杏园前茬为菜地，可在定植前先挖好定植穴，用硫酸铜灌穴消毒来灭菌，每穴约10—15公斤。定植时嫁接口应高于地面10—15厘米。及时整修杏园的排水系统，以保证雨季果园内不积水。春季土壤解冻后要立即把根颈部位的土壤扒开，晾晒根颈、并仔细检查根的皮层，发现病斑及时刮除，再在伤口上涂抹25%瑞毒霉50—100倍或40%乙磷铝30—50倍，每隔7—15天涂抹一次，一般2—3次即有效。
刮除的有病树皮要清理干净，带出园外烧毁。冬季土壤封冻前，再把扒开的土堆放在根颈部防冻。
对于病害严重的果园，可用25%瑞毒霉800—1000倍或40%乙磷铝300倍，每株按45—50公斤灌根部，为防病菌的扩大蔓延，尚未感病时树也应灌根、浇树。如已死的树要及时挖掉，并用40%的乙磷铝30—50倍液灌穴消毒，并晾晒土壤，再经过土壤检验，确定无病菌时才能重新再建新园。
