复合肥养分全面，含量高，物理性状好，但在施用过程，要注意三个问题：
1、因土壤因作物选择复合肥料的品种，才能发挥其肥效。
2、复合肥料应与单质肥料配合施用。
复合肥中的营养成份是固定的，只有与各种单质肥料配合施用，才能满足作物不同时期对养分的需求。一般来说复合把适合作基肥，而单质肥料可作追肥施于作物需肥的高峰期和关键期。
3、使用方法得当。
各种复合肥中，各种营养成分的比例和形态是不一样的，加上土壤和作物种类不同，施肥的方法也不应一样，要区别对待。粘性土壤保肥力强应深施，沙质土壤易脱肥，可少量多次施用。对含铵态氮的复合肥料，应深施覆土，减少损失，对含磷、钾养分的复合肥，应集中施用，施于根系附近，既避免养分被固定，又便于作物吸收利用；对价格昂贵的磷酸二氢钾，一般不应作基肥，而适宜作根外迫肥或用以浸种。
