芝麻是双子叶植物，子粒细小，在播种时覆土比较浅，因此选择除草剂必须严格以免造成药害。芝麻田化除有两种方式：一是播后苗前用药；二是苗后杂草出齐时。
苗前封闭化除：由于芝麻粒小、播种浅，很多种封闭除草剂品种对芝麻易于发生药害，生产上应注意适当深播。同时，施药时要注意天气预报，如有降雨、降温等田间持续低温高温情况，也易于发生药害；因为芝麻杂草防治的策略主要是控制前期草害，芝麻田中后期生长高大密蔽，芝麻田中后期算自身具有较好的控草作用，所以芝麻田除草剂用药量不宜太高。
在芝麻播后3天内，亩用96%异丙甲草胺70-120毫升或48%甲草胺乳油200-250毫升，加水30公斤稀释后均匀喷雾于地表。土质粘重或土壤有机质含量丰富的田块，应适当增加用药量。33%二甲戊乐灵乳油，以100-150毫升/亩，兑水30公斤均匀喷施，可以有效防治多种一年生禾本科杂草和藜、苋、苘麻阔叶杂草，对马齿苋和铁苋也有一定的防治效果。施药时一定要视条件调控药量，切忌施药量过大。生产中应均匀施药，应先试验比较，否则易发生药害。
另外，生产上一些农民朋友使用乙草胺作芽前化除使用，结果大都出现药害，造成不出苗或毁种。但有少数使用成功的，成功的措施是开沟播种，覆土比较厚(1厘米以上)的田块。总之不能推广，属不安全药剂。
苗后化除技术：对于前期未能采取有效的杂草防治措施，在苗后时期应及时进行化学除草。施用时期宜在芝麻封行前、杂草3-5叶期，用10%精喹禾灵乳油20-30毫升/亩、10.8%高效吡氟氯禾灵乳油20毫升/亩、15%精吡氟禾草灵乳油50-75毫升/亩、12.5%烯禾啶·机油乳油50-75毫升/亩，24%烯草酮10-20毫升/亩，加水25-30公斤/亩配成药液选择雨后初晴，或早有晚露水时喷洒，土壤干旱时要加大稀释用水量，以提高药效。这些除草剂均可用于防治禾本科杂草，对阔叶杂草基本无效。土壤水分适宜、杂草生长茂盛时防效较好。
目前还没有芝麻苗后茎叶处理防除阔叶杂草的安全药剂，如田中阔叶草较多应进行早期土壤封闭处理。
无论防治禾本科杂草还是阔叶杂草，施药过程中要注意如下几点：一是土壤墒情要足，墒情较差时要增加施药量；二是土壤粘重的大田也要适当增加用药量；三是防除茎叶杂草，要选择在3-5叶期，苗龄较长的也要增加用药量；四是芝麻田用药技术要求较高，所有适用药剂都需经过小试后推广。
