莲藕生长发育分3个时期，即萌芽期、旺长期和结藕期，萌芽期从植株萌芽到立叶出现。立叶后藕长出新根，主要靠藕贮藏的养分；旺长期从植株立叶到开始结藕，养分需求量大，是追肥的关键期；结藕期从结藕到采收，藕和莲子同步发育，养分吸收减少，茎秆和叶片养分大多向藕和莲子转移。因此，总共要施3次肥。栽藕前将基肥翻入田中，一般亩施腐熟优质农家肥2000-3000公斤，通用复合肥40-50公斤。追肥有2次。第一次是立叶肥，在田间出现3-5片立叶时，亩施氮磷型复混肥25-30公斤；第2次是满田立叶时，亩施氮钾型复混肥30-35公斤。
另外，浅水藕田和深水藕田施肥不相同，浅水田既可施复混肥，又可施单质化肥。施前排水，浅水施肥，施后两天再恢复水层。深水田则把复混肥与泥土混合施用为好，这样可以防止肥料漂浮。
