根腐病发病初期，玉米苗根尖或根中部出现褐色病斑，病斑不断扩展，可使全部根系变褐，须根初期表现水渍，变黄，后腐烂坏死，根皮容易脱落。病害可蔓延至地上部，茎基、叶片出现云纹状褐色病斑。严重时，叶片出现火烧状枯死。茎基也发生腐烂，用手轻轻一提即可拔起。苗期根腐病的主要致病菌为串珠镰刀菌和禾谷镰刀菌。镰刀菌可以通过根腐病发病后在植株体内扩展到茎基部引起茎腐病，再沿茎秆扩展到穗部，引起玉米穗腐病，播种期为镰刀菌最佳侵入期，根腐病发病率最高。病株秸秆还田可增加根腐病的发病率，缺钾而重施氮肥的地块病害加重，施用钾肥和有机肥，玉米根腐病的发病率降低。
防治方法如下：
1.增施硫酸钾、氯化钾或含钾复合肥，每亩用纯钾6～7公斤作基肥。多划锄，提高地温。加强肥水管理，促苗壮。杜绝病株秸秆还田，减少再侵染源。
2.用钾肥灌根防治，病株率在10％以上的，亩用氯化钾3～5公斤，或草木灰50公斤。病株率在10％～20％的，亩用氯化钾8～10公斤，或草木灰80～100公斤。病株率在30％以上的，亩用氯化钾10～15公斤，或草木灰100～150公斤。施用时，将氯化钾溶水灌埯，草木灰宜单独施用，切忌与化肥和水粪一起施用。也可选用多元复合微肥加磷酸二氢钾叶面喷雾。
3.药剂防治，用40%根腐宁600倍液或50%多菌灵+40%乙磷铝1000倍液或70%甲基托布津+40%乙磷铝1000倍液每株用100克药液灌根。
