菌核病是芥蓝的一种重要病害，一般在连作地，气温20℃，低洼排水不良地及偏施氮肥，湿度大时，有利于此病的发生。
该病的发生贯穿芥蓝的整个生育期，其中以生长中后期发生较多。一般是从下部叶片和茎开始发病，叶片上发生水渍状淡褐色病斑，在潮湿条件下病根很快就腐烂，并产生白色絮状菌丝体和黑色菌核。茎部病斑稍凹陷，由淡褐色变白色，最后茎腐朽呈纤维状，茎中内空，产生白色絮状菌丝体和黑色菌核。一般，可采用以下措施进行防控：
1.农业措施。播种前把床温调至55℃处理2小时，可以有效杀死土壤中的菌核。前茬收获后进行一次深耕，将菌核深埋土中，使其不能抽生子囊或子囊盘不能出土，减少子囊孢子的传播。高畦种植，合理密植，同时开好排水沟，降低田间湿度，增强植株生长势，合理使用氮肥，增施磷钾肥，提高抗病性。
2.药剂防治。发病初期，可选用50%腐霉利可湿性粉剂1000倍液，或50%乙烯菌核利可湿性粉剂1000倍液、50%异菌脲可湿性粉剂1000倍液、50%硫菌灵可湿性粉剂1000倍液、40%菌核净可湿性粉剂1000倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液喷雾。
