化学肥料的频繁使用导致土壤肥力日益减弱，使泰宁县的农田土壤结构发生了很大的变化，土壤是作物赖以生长的基地，高肥力土壤必须具有良好的团粒结构，为作物调控适宜的水、肥、气、热，为作物转化、保存并持续提供所需营养元素。这主要依靠土壤中生活的、每克土以亿计的微生物的作用，而微生物生活主要靠有机质维持。自然生态系统中，植物是生产者，动物为消费者，微生物为分解者。地球表面有限的营养元素就靠微生物这个分解者，才能进行循环使用。
这个分解作用，主要在土壤和水体中进行。所以最合理的措施是尽可能将动植物废弃物投入土壤中，促进微生物大量繁殖。微生物将有机质分解，释放出营养元素，供植物生长利用，形成高肥力。同时，也合成它们自身的细胞，将营养元素在细胞中保存而不被流失。微生物死后，营养元素又可被矿化给植物利用。另一方面，微生物也不断将有机物转化为腐殖质。腐殖质与微生物分泌的大分子物质一起，使土壤矿质颗粒凝聚成团粒结构，营造适于植物保水、保肥、调温、通气的生长环境。所以土壤腐殖质的含量常用作衡量土壤肥力的指标。
最关键的是有机肥的使用可以减少化肥依赖、是培植高肥力土壤的一条有效途径。如能将种、养业产生的废弃物变成有机肥料，既可养地，又可减少污染，是实现绿色农业的重要措施，这也符合自然界元素生物小循环的规律。目前在秸秆免耕覆盖中存在的某些问题，需在农业现代化进程中进一步研究解决。土壤是不可再生的宝贵资源，不仅要注意保量，也要保质，即保持其肥力水平。
