微量元素肥料（简称微肥）是指含有微量元素养分的肥料，如硼肥、锰肥、铜肥、锌肥、钼肥、铁肥、氯肥等，可以是含有一种微量元素的单纯化合物，也可以是含有多种微量和大量营养元素的复合肥料和混合肥料。可用作基肥、种肥或喷施等。
微量元素是指自然界中含量很低的一种化学元素。部分微量元素具有生物学意义，是植物和动物正常生长和生活所必需的，称为“必需微量元素”或者“微量养分”，通常简称“微量元素”。必需微量元素在植物和动物体内的作用有很强的专一性，是不可缺乏和不可替代的，当供给不足时，植物往往表现出特定的缺乏症状，农作物产量降低，质量下降，严重时可能绝产。而施加微量元素肥料，有利于产量的提高，这已经被科学试验和生产试验所证实。
定量的说，对于作物来说，含量介于0.2～200毫克/公斤（按干物重计）的必需营养元素称为“微量元素”。到目前为止，证实作物所必需的微量元素有硼、锰、铜、锌、钼、铁、氯等。这些元素经过工厂制造成肥料，就叫做微量元素肥料，如七水硫酸锌属于锌肥，硼砂、硼酸属于硼肥，硫酸锰属于锰肥，钼酸铵属于钼肥，硫酸铜属于铜肥，硫酸亚铁属于铁肥等。
