在新建日光温室过程中，后墙用土量大，多年耕作的富含有机质的表层土大多被取走，加之新建时采用机械作业，土壤结构遭到破坏逐渐变为坚实的无结构状态。而蔬菜生产需要有机质丰富（4％－6％之间）、质地沙黏适中、团粒结构好、土层深厚、酸碱度适宜、土质比较疏松、不易板结、透气的土壤。因此新建的日光温室要注重土壤改良，通过土壤耕作和增加土壤有机质，以宜于蔬菜栽培。
1.土壤耕作：通过深挖晒垡，对土壤耕层和地面进行翻、松、碎、平作业，以加深耕层，改善土壤结构，调节土壤中水、肥、气、热等因素存在状况，使土壤耕层疏松，增加土壤总孔隙和非毛细管孔隙，从而增加土壤的通气性和容水量。通过耕作，把因机械压力遭到破坏逐渐变为坚实的无结构状态的土层翻下去，把下层具有较好结构性的土壤翻上来，恢复土壤耕层和团粒结构。
2.结合耕作，增施有机肥，使肥土相融：由于在新建日光温室过程中富含有机质的表层土大多被取走，故此新建温室首要的问题是增加土壤中的有机质含量。土壤有机质具有提供作物所需要的养分和提高养分的有效性，改善土壤的理化性状，增强土壤的保肥性能和缓冲性能。新建温室最好主要以施用含木质素、纤维素多的有机肥，如牛粪、羊粪和作物秸秆等，每亩有机肥施用量应在0.5万－1万公斤左右。而不能以施用含速效性养分多且分解快的鸡粪、猪粪等肥料为主，因此类肥料含木质素、纤维素较少，对土壤腐殖质形成作用不大。
