水稻施用的有机肥种类繁多，有人、畜、禽粪尿，土杂肥、厩肥、堆肥、沤肥和绿肥等。施用有机肥的好处是：
（1）有机肥原料来源广，可以就地取材，就地积制，只花工夫，不需投入多少资金，可节省化肥，降低生产成本。
（2）有机肥含有多种营养元素，除含氮、磷、钾等大量元素外，还含有许多作物所需的中量元素和微量元素，能给水稻提供全面的所需营养，特别是提供微量元素营养。同时能提高稻米的品质和适口性。
（3）有机肥含有机质和腐殖质，能改良土壤结构，协调土壤的水、肥、气、热，增强土壤的通气透水能力和保肥、保水、供肥、供水能力。
（4）有机肥含有生长素、维生素、胡敏酸和氨基酸等有机物质，对水稻营养生理和生物化学过程能起特殊作用，还能提供二氧化碳气体供水稻光合作用之用。
（5）有机肥缓冲性大，可缓和土壤酸碱性变化，可清除或减轻盐碱类土壤对水稻的危害。
（6）有机肥适用性广，对各类土壤及各种农作物都适用。
此外还可以变废为宝，清洁环境，有利改善生态环境，促进农业可持续发展。
