12月16日，2012年化肥关税方案正式出台。尿素、磷酸一铵、磷酸二铵等大肥种明确基准价扣除关税，相当于变相提高出口基准价，有一定的利好作用。而氮磷二元肥、10千克以下小包装化肥、氯化铵等小肥种的出口关税则大幅度提高，出口明显收紧。
明年尿素、磷铵等大肥种的关税方案与今年一样，旺季（尿素为1～6月，11～12月；磷铵为1～5月，10～12月）征收110%关税。淡季，如果在基准价以下，征收7%关税；基准价以上，按公式[税率=(1.07-基准价格/出口价格)×100%]计算，实行浮动关税，出口价越高，关税税率越高。尿素基准价为2100元（吨价，下同），磷酸一铵为2900元，磷酸二铵为3400元。今年由于基准价是否含税问题（关税7%）未明确，海关实际上是按含税执行的，相当于没有达到基准价（尿素只达到1963元、磷酸一铵2710元、磷酸二铵3178元）就要开始按公式计算关税，出口企业利益受损。而在2012年关税方案中，明确规定“其中的关税税额，应当予以扣除”，相当于出口基准价变相提高，尿素提高137元，磷酸一铵提高190元，磷酸二铵提高222元，这对出口有利，是个利好。
今年由于大肥种关税控制严，出口受到了抑制，1～10月我国尿素出口量同比下降41.2%。而氮磷二元肥、10千克以下小包装化肥、重钙等小肥种由于关税低，全年都是7%的低关税，出口异军突起，大幅飙升。1～10月，氮磷二元肥出口高达295万吨，同比增长489.6%；重钙出口155.8万吨，比去年全年的出口总量121.3万吨还多34.5万吨；小包装化肥出口也同比增长4倍以上。明年这些肥种无一例外的都采取了和大肥种相类似的关税标准，淡旺季窗口期同大肥种，淡季税率7%，旺季税率统一为82%。旺季税率比大肥种稍低，但实际上也难以出口。另外就是淡季没有基准价，比大肥种略为宽松，不过实际作用不大。
肥料用氯化铵今年是零关税，明年则提高到淡季7%，旺季82%，成为关税提高幅度最大的一个品种。今年氯化铵价格偏高，一方面由于零关税，自身出口量大；另一方面由于氮磷二元肥大量出口，造成氯化铵变相出口，氯化铵和磷酸一铵成为氮磷二元肥大量出口的最大受益者。明年随着氮磷二元肥出口被堵和氯化铵关税的大幅提高，氯化铵价格预计会回落到合理价位，磷酸一铵价格过高的状况预计也将有所改变。
硫酸铵由于系脱硫环保产品，明年继续实行零关税，成为化肥产品中为数不多的零关税品种。今年硫酸铵出口量较大，每月出口量均在12万吨以上，1～10月共出口硫酸铵150万吨，明年硫酸铵出口量依然会较大。
其他如硝酸铵钙、尿素硝铵溶液、氰氨化钙、氨水等因出口量小，关税未调整，明年仍为7%。氯化钾、硫酸钾等主要钾肥品种明年继续执行全年105%的高关税。氮磷钾三元复合肥也继续执行高关税，1～9月为110%，10～12月为95%，和今年一样。
为避免漏洞，2012年关税方案中将“其他肥料”的关税也大幅提高，淡季7%，旺季82%，采用一刀切的方式予以封堵，避免有些企业自创化肥名称或用其他手段来达到低关税出口目的。
总体看，2012年化肥关税政策趋紧，大肥种的利好实际上是政策“纠错”，而非“放松”，小肥种特别是今年出口量大的品种则是明显收紧，2012年化肥出口量预计会较2011年下降。化肥企业，应把眼光主要放在国内市场，出口只能起辅助作用。
