1 合理有效的轮作——降低土壤中病虫害积累
无论是保护地还是大田蔬菜生产，轮作都是减轻病虫害发生的有效措施。最好能做到水旱轮作，相差巨大的栽培环境能较大地改变土壤中微生物的结构，从而降低土壤中病虫害的积累。如果不能安排水旱轮作，则要求同一种蔬菜在同一田块上连续生产不超过两茬，且上下茬不要为同科的蔬菜。同时如果可以的话，尽量安排与葱、蒜等作物进行轮作，因为葱、蒜等作物能分泌抑菌物质，从而有效降低土壤中病原微生物的水平，减少病原物的初接种量。
上图中未进行轮作，枯萎病发生严重
下图为长期进行水旱轮作地块，未发生枯萎病：
2 施用微生物菌肥——限制土壤中病原微生物生长
无论在常规蔬菜生产，还是在无公害蔬菜或绿色蔬菜生产过程中，都需要注重微生物菌肥的施用。微生物菌肥自身含有有益微生物和所用基质。这些有益的微生物往往能有效地产生拮抗物质或者铁载体，能够限制土壤中病原微生物的生长，从而降低其水平。微生物菌肥中的基质不仅能为植物生长提供营养，有些基质还能特异性地促进土壤中有益微生物的生长。菌肥中的有益微生物作为外来微生物，其能否在土壤中有效地定殖是能否防治土传病害的关键，也是能否促进蔬菜生长的关键。所以在实际的农事操作过程中，往往先将微生物菌肥（微生物固体菌剂）与腐熟的有机肥进行混合，然后再作为基肥施用。这在一定程度上保证了有益微生物在土壤中的定殖，通过与土壤中的病原微生物形成竞争或者拮抗关系，来降低土壤中病原微生物的数量。
3 闭棚硫磺熏蒸——对土壤和大棚达到消毒灭菌效果
硫磺为常用的矿物源杀菌剂，具有杀菌、杀螨和杀虫的作用，在无公害蔬菜和有机蔬菜生产过程中常被使用。在大棚蔬菜生产时可以用硫磺熏蒸的方法来对土壤和大棚进行消毒灭菌。具体的操作为：在蔬菜定植前7~10天，密封大棚，每50 m3空间大致用120 g硫磺粉和230 g干锯木末，将硫磺粉和干锯木末混匀，放在瓦盆（或者瓷盆）中，然后点燃，人退出棚外，关好大棚，熏蒸一夜或者密封24 h，再放风透气。
4 施用生石灰调节土壤pH值——抑制土传病原菌生长
土壤中微生物的种类和数量与土壤的pH值紧紧相关，因此某些土传病害的发生与流行也常常与土壤的酸碱性相关，比如，十字花科蔬菜的根肿病、茄科蔬菜的青枯病等，在酸性土壤中更易发生，而在中性和碱性土壤中却很少发生，所以在此类蔬菜的生产过程中，可以通过施用生石灰的方式来对这些病害进行防治。作为碱性物质的生石灰，其本身就是一种良好的矿物源的无机类杀菌、杀虫剂。生石灰的施用一方面能对土壤中的病虫害起到一定的杀灭作用；另一方面又能改变土壤的pH值，抑制某些微生物的生长，从而改变土壤中微生物的结构，使之不利于某些土传病害的发生和蔓延。生石灰的施用量一般参照每667 m2施100 kg进行处理，同时应该注意生石灰也不能连续大量施用，一般每隔2年施用1次。
5 高温闷棚消毒处理——降低土壤中病原菌数量
夏季，当蔬菜收获后，翻耕后浇透水，密封大棚进行高温闷棚消毒处理一周；对于露天田块也可以通过阳光晒土的方式进行高温消毒处理。较高的土壤温度能有效降低土壤中的病原微生物数量，有利于土传病害的防治。结合稻草还田（秸秆还田）与施用生石灰进行闷棚是现在较为流行的又一闷棚方式，即：在春夏空茬时期，将大棚中的土壤进行深翻并打碎，参照每667 m2碎稻草500 kg和生石灰100 kg的施用量，将碎稻草与生石灰均匀地撒施到土壤中，再次翻土并浇水，用塑料膜覆盖并压实，然后关好大棚进行闷棚处理10~30天。高温闷棚处理后，可以再结合微生物菌肥的施用，向土壤中接种有益的微生物。
上述处理措施均不涉及到化学农药的使用，是保证安全健康蔬菜生产的有效措施。因此，这些安全的防治土传病害的措施在无公害蔬菜和绿色蔬菜生产过程中尤其重要。
