2016年12月25日，十二届全国人大常委会第二十五次会议表决通过了《中华人民共和国环境保护税法》(以下简称《环保税法》)。这是中国第一部专门体现“绿色税制”、推进生态文明建设的单行税法，将于2018年1月1日起施行。届时，已施行三十余年的排污收费制度将结束使命，退出历史舞台。《环保税法》经多年博弈之后出台，被认为中国环保领域一大进步。同时，新法出台将对农药、化肥等生产环节增强约束，从而倒逼行业转型升级。
据财政部相关负责人介绍，与其他税不同，环境保护税是从税收杠杆入手，企业多排污就多交税;企业履行环保责任，减少污染物排放，就可以少缴税，享受税收减免。
《环保税法》规定：大气污染物税额为每污染当量1.2-12元人民币;水污染物为1.4-14元;固体废物按不同种类，税额为每吨5元至1000元;噪声按超标分贝数，税额为每月350元至1.12万元。此外，对于纳税人排污浓度值低于标准的，设置了两档减税优惠，即纳税人排污浓度值低于规定标准30%的，减按75%征税;纳税人排污浓度值低于规定标准50%的，减按50%征税。
当被问及《环保税法》施行对农药行业影响，中国农药工业协会秘书长李钟华表示，《环保税法》的实施有助于企业提升减排意愿，促进行业转型升级，淘汰环保不达标的企业。与缴纳排污费相比，费改税以后可提高纳税人的环保意识，有利于提高环保设施的投入与运行，少排少交税。《环保税法》2018年实施，给企业留有一定的改进提升时间。企业应抓紧时间，改进提升清洁生产工艺，改善提升环保设施，为《环保税法》的实施做好准备。
北京华通纵横经济信息有限公司总经理杨益军表示，环保税政策丰富了农化供给侧改革途径，政策如果有效实施，对农化中小企业压力很大，有利于出清落后产能，提高行业集中度及企业国际竞争水平，由于税收杆杠可以互相补给，比如排污费用增加了，其它税收可以反补给企业，这样可以提高规模企业环保排放的积极性。至于环保税收，短期内对大宗农药是挺价，或者支撑价格上涨;长期来看，排污的费用有可能转嫁到价格上。
化肥行业人士表示，环保压力对于二次加工复合肥企业的影响有限，但是对于合成氨、磷铵等基础化工品影响较大。同时也有行业人士指出此前各地关于环保生产收费的标准不统一，地域色彩明显，环保税一旦出台，就意味着全行业一个标准，企业同处于同一个起跑线，有利于创造公平、透明的竞争环境。
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