日光温室南瓜立架栽培的病虫害防治药以预防为主，综合防治。在预防病害方面，加强通风透光，增施有机肥，保持植株健壮生长，同时适量喷药，以波尔多液为主，每10---12天喷1次，花前喷240倍等量式波尔多液，坐瓜后喷200倍等量式波尔多液；如病害已发生，可针对病害种类选择其他高效低毒杀菌剂。
常见的病害有枯萎病、炭疽病、疫病、霜霉病等。对于枯萎病应及时拔掉病株，带到室外烧毁，对带病的土壤应及时撒上生石灰消毒。炭疽病、疫病、霜霉病等，可用世高、和瑞、爱苗、阿米西达、金雷多米尔等喷雾，也可用百菌清烟雾剂熏烟防治。
害虫主要是蚜虫和白粉虱等，可用阿立卡、绿浪、吡虫啉、蚜虱净、乐斯本等喷雾。也可用敌敌畏烟剂熏杀，22%的敌敌畏烟剂用量每亩60--90克。
