南瓜是雌雄异花授粉的植物，主要依靠蜜蜂、蝴蝶等昆虫媒介传粉，受精结果。在自然授粉的情况下，异株授粉结果率占65%，本株自交授粉的结果率站35%。从人工授粉和自然授粉的效果来看，人工授粉的结果率可高达72.6%，而自然授粉的结果率仅有25.9%。所以，人工授粉对提高南瓜的结果率极为有利，特别是在南方栽培南瓜，开花时期正值梅雨季节，湿度大，光照少，温度低，往往影响南瓜授粉与结果，造成僵蕾、僵果或化果。采用人工授粉的方法可以防止落花，提高坐果率。
人供授粉的具体做法是：南瓜花一般在凌晨开放，早晨4--6时授粉最后，所以人工授粉要选择晴天上午8时前进行。可采摘几朵开放旺盛的雄花，用蓬松的毛笔轻轻地将花粉刷入干燥的小蝶内，然后再蘸取混合花粉轻轻涂满开放雌花的柱头上，授粉以后，顺手摘张瓜叶覆盖，勿使雨水进入，以提高授粉效果。采用混合花粉授粉，有利于提高坐瓜率和果实质量，也有的将雄花采摘后，去掉花瓣直接套在雌花上，使花粉自行散落在雌花柱头上，或把雄蕊在雌花柱头上轻轻涂抹，这样也可达到人供授粉的目的。如遇阴雨天，则可把翌日于凯雌花、雄花用发夹或系保险丝束住花冠，待翌日雨停时，将花冠打开授粉，然后再用叶片覆盖授过粉的雌花。
南瓜上也可应用植物激素促进开花和坐果。在南瓜长出3--4篇真叶时，用乙烯利2500倍稀释液（一般采用2.5升水加1毫升乙烯利原液）直接喷洒瓜苗，促进瓜苗雌花分化，幼瓜早结。
在南瓜花期，用20---25毫克/升的2,4-D溶液于正开的雌花花柄上，可防止果柄脱落，提高结果率。
