秸秆腐熟剂是能加速各种农作物分解、附属的微生物活体制剂，目前，研制开发立项的作物秸秆快速腐熟剂的一个热点。我国年产作物秸秆达5亿吨之多，用秸秆制作肥料，不仅可减少污染，还可以变废为宝。加之秸秆来源广泛，可以是玉米杆、稻草、麦秸、豆秸、谷草、高粱秸以及各种藤蔓等，可因地制宜，就地取材。而常用的物理机械法和化学碱处理法，都存在诸多缺点，秸秆的营养价值和利用价值都不高。所以，利用微生物的广泛适应性和多功能来转化秸秆已日益受到国内外研究者重视，因为微生物在秸秆转化中有用途多、营养价值高、周期短、可再生等优点。用微生物学方法处理秸秆具有其他物化方法博客替代的优点，作为利用秸秆资源的新途径，有着广阔的应用前景，将在农业生产中发挥越来越重要的作用。
分解秸秆的微生物种类 作物秸秆的主要成分是纤维素、半纤维素和木质素。可以分解利用的微生物种类很多，在自然界中广泛分布和存在。主要分类如下:
1. 能分解纤维素的细菌芽孢杆菌、类芽孢杆菌属、假单胞菌属、弧菌属、微球菌属、链球菌书、纤维黏菌属、等，最值得注意的是这些种类中的嗜热和耐热的种群
2. 能分解纤维素和版纤维素的真菌木霉素、曲霉属、青霉、分枝孢属、轮枝孢霉、镰刀菌属、根霉等。
3. 能分解纤维素的放线菌分枝杆菌、诺卡菌、小单胞菌、链霉菌红素的等。
4. 氧化木质素的微生物有洋蘑菇、鬼伞菌、茯苓、多孔菌属、伞菌属、糙皮侧耳、韧皮均属等
研发和生产秸秆腐熟剂在明确产品使用环境条件下，即使说，含有”三素酶”的微生物腐熟剂才是最科学、合理的;也是保证秸秆腐解效果的基础。之外的菌种需要要进过产”三素酶”能力测定和安全性评价达到要求才能作为秸秆腐熟剂生产用菌种。需要说明的是，除之外的菌种仅是初步的划分，还需进一步补充或调整。
