一，光合细菌可有效提高土壤生物活性
光合细菌无论是单独使用还是同其他肥混用，都会在土壤中表现出一定的增殖特性，并使土壤汇中生物总量增加，从而促进土壤中物质的循环和能量流动。尤以光合细菌与有机肥混合使用效果最佳。
光合细菌和有机肥显著促进土壤中放线菌、异养细菌、固氮菌、氨化细菌和硝化细菌的生长，而抑制反硝化细菌数量。施用光合细菌和有机肥可以改善土壤微生物区系，光合细菌作用比有机肥更稳定和持久。
二，光合细菌提高蔬菜品质和产量
光合细菌菌剂处理在种植期间每隔10天喷施一次稀释200倍的光合细菌菌剂可有效提高蔬菜的安全品质，蔬菜的可溶性糖含量和蔬菜中的维生素C含量。另外光合细菌还能诱导烟草产生抗病毒感染的活性，使病毒的危害减轻。
三，光合细菌可有效提高水稻品质和产量。
四，光合细菌可有效降解土壤、作物残留农药
光合细菌能明显提高铅、镉和呋喃丹复合污染土壤酶的活性，改善土壤的环境质量，为光合细菌修复重金属及农药土壤污染的推广应用提供实验依据。
