和喷灌系统的组成一样，一套完整的微喷灌系统通常也包括水源工程、首部枢纽、输配水管网、微喷头、自动控制设备等。
一，水源工程
要使微喷系统能够正常运转，必须要有足够的水源保障，一般可以作为微喷灌用水的水源有河流、湖泊、水库、池塘、泉水、井水或渠道水等。微喷灌用水水源工程的作用是通过水源工程续集、沉淀及过滤作用，为微喷灌系统的正常运行提供足够的水源。由于微喷头的出水口径要小于喷灌系统喷头的出水口径，因此微喷灌系统的水源水质方面较喷灌系统有更高的要求。
二，首部枢纽
首部枢纽包括水泵、动力机、肥料和化学药品注入设备、过滤设备、控制阀、进排气阀、压力机流量测仪表等。其作用是从水源取水增压将其处理成复合微灌要求的水流送到系统中去。
三，输配水管网
输配水管网的作用是将首部枢纽处理过的水按照要求疏松分配到每个灌水单元和灌水器，输配水管网包括干、支管和毛管三级管道。毛管是微灌系统最末一级管道，其上安装的管道常用聚乙烯管材，大于或连接灌水器。微灌系统中，直径小于或等于灌水器的管道常用聚氯乙烯管材。
四，微喷头
微喷头是微灌系统的标志性设备，其作用主要在于将管道内的连续水流喷射到空中，形成众多细小水滴，洒落到空气中或地面的一定范围内以补充土壤水分。微喷头必须满足的基本要求有：能使连续水流变为细小水滴或雾化水滴；能使水滴均匀地喷洒到空气中或地面一定范围内，达到合理的水量分布；灌溉时单位时间内喷洒到地面的水量适应土壤入渗能力，不产生地表径流。
