一，微生物拌种剂
利用多孔的物质作为吸附剂（如草炭、蛭石），吸附菌体的发酵液而成菌剂，这种菌剂用于拌种。有益微生物通过其生命活动增加植物营养元素的共赢，改善植物营养状况而增产。其代表品种为各类根瘤菌肥料，主要应用于豆科植物，使其能在豆科植物根、茎上形成根瘤，同化空气中的氮素来供应植物氮素营养。
二，复合微生物肥料
也可将两种或两种以上微生物（固氮菌、芽孢菌或其他一些细菌）互补拮抗、互相有利，通过其生命活动使作物增产，其作用不仅提高营养元素的供应水平，还包括菌在繁殖过程中自身产生的各类植物生长刺激素，拮抗某些病原菌，达到一致病害的目的，尤其是土传病害，例如线虫病害、全蚀病、青枯病、枯萎病等。有的菌剂能活化土壤中被固定的磷钾矿物，使之被植物吸收。另一些菌剂能加速作物秸秆的腐熟和促进有机废物发酵。
三，腐熟促进剂
一些菌剂能加速作物秸秆的腐熟和促进有机废物发酵，主要由纤维素分解菌构成。
