辣椒的生育特性与番茄相似，但叶也有不同之处。
根系不发达：辣椒的根量少、入土浅，根群大多分布在10-15cm以内的表土层中；根的母栓化较早，发生新根的能力差；辣椒根对土壤中的氧气含量特别敏感，缺氧（尤其是发生涝害时）很容易整株死亡，可见辣椒根系既不抗旱，又不抗涝。此外，辣椒根系还不耐土壤溶液高浓度。
营养生长和生殖生长的矛盾不明显：当辣椒长出4片叶，茎粗0.15--0.2cm，株高3--4cm时就开始花芽分化，此时辣椒已经分化形成11-12片叶。辣椒的花芽分化早而且有连续性，生殖生长与营养生长并进的时间长，但矛盾不如番茄尖锐。因为辣椒花芽分化与番茄相比还是稍晚一些，有一定营养生长基础，而且单花、单果，不易发生果坠秧现象。辣椒营养体的生长量和生长速度也小于番茄，不像番茄那样易徒长。
分枝和开花结果习性有明显的规律性：与茄子相似有假二叉分枝现象，各级分枝所结的果实依次被称为“门椒”、“对椒”、“四母斗”、“八面风”和“满天星”。
喜湿、耐荫且喜肥：辣椒在苗期往往比番茄要求有更高的温度，在28--30℃的温度下不仅发芽快而且整齐，到生育后期又有一定耐低温的能力。辣椒与番茄相比有一定的耐荫性，而且中等光照有利于减轻辣椒的病毒病，过强的光照暴晒地面对辣椒根系的发育不利。另外辣椒喜湿但怕涝，喜肥但不耐土壤溶液高浓度。
辣椒易落花、落果、落叶。一般落花率可达20%--40%，落果率5%--10%。早春落花主要是由于低温影响了授粉即花粉管的生长所造成，盛果期落花、落果主要是高温干旱导致病毒病发生，或高温多雨使根系吸收能力减弱，导致植株生理失调而引起。通过培育壮苗，加强肥水管理等措施可以防止落花落果。辣椒秧苗对养分的吸收量不大，但氮、磷等养分供应不足，对辣椒生育和产量的影响是不可弥补的，所以说苗期是辣椒需肥的敏感时期。
