日本科学家报告说，单个基因中的变异似乎决定了葡萄的颜色。他们的研究推测，由于一种变异抑止了名为“花青素”的颜料的生产，黑葡萄演化出了白葡萄。它还表明，红葡萄不是这一演化过程的中间步骤，取而代之，实际上是第二个变异将花青素的生产恢复，白葡萄中又长出了红葡萄。ShozoKobayashi发现，涉及到花青素生产的其中一个基因只在特定的红葡萄种属中被表达，但没有出现在白葡萄中。在白葡萄种中，一系列名为“反转座子”的入侵DAN将自己插入基因中，防止葡萄产生出色素。对红葡萄的进一步检查显示了反转座子在离开这种基因前所留下的分子痕迹。研究人员推测，即使不是全部，这种变种基因也已经扩散到了全世界的绝大多数白葡萄培育植物中。
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