马铃薯采收后，堆放在场院或入窖入库遭受冻害、冷害，在北方是常见事。通常低于-1.7℃，马铃薯便受冻害。块茎外部出现褐黑色的斑块，薯肉逐渐变成灰白色、灰褐色直到褐黑色。如局部受冻，与健康组织界线分明。以后薯肉软化，水烂，特别易继而被各种软腐细菌、镰刀菌侵害。受冷害的马铃薯往往外部无明显症状，内部薯肉发灰。这类块茎煮食时有甜味，颜色由灰转暗。冷害程度较重的可使韧皮层局部或全部变色，横剖块茎，切面有一圈或半圈韧皮部呈黑褐色；严重的四周或中央的薯肉变褐，如发生在中央，则易与生理性的黑心病混淆。
防治：应不将田间已经受霜冻、冷害的马铃薯入窖（库）贮藏；贮库温度宜保持在3.5～4.5℃，且库内有足够的氧气可供呼吸，故应适当通风。
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