丝瓜留种田需要有500~1000米的隔离区。选留丝瓜种子，一般以株选效果较好。选留种子时，选择具有本品种特性的植株。一般要求节间短、节间均匀、叶片大小适中、叶柄短、结瓜早、丝瓜条上下粗细均匀的植株留作种株，在生育中期人工受粉后套袋，防止杂交。套袋的方法：在雌花开放时，用自花的雄蕊对花后，套上小纸袋，花冠萎缩后就可去掉，把种瓜作好记号，不要误采。一般每株可留种瓜3~4条。
瓜种采收时间最好在植株自然枯死后采瓜剖种，种子晒干后收藏。
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